Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cnn3Q9DAW9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms