Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpl4Q9D8E6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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