Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm5Q9D6G9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm5Q9D6G9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms