Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ptp4a3Q9D658 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ptp4a3Q9D658 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ptp4a3Q9D658 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ptp4a3Q9D658 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ptp4a3Q9D658 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms