Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt34Q9D646 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt34Q9D646 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt34Q9D646 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms