Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms