Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cfap53Q9D439 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap53Q9D439 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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