Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx29Q9D3S3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx29Q9D3S3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms