Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Stag1Q9D3E6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Stag1Q9D3E6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms