Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rufy3Q9D394 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms