Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim42Q9D2H5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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