Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Trappc6bQ9D289 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc6bQ9D289 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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