Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Spns3Q9D232 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Spns3Q9D232 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms