Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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