Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hddc3Q9D114 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms