Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tmem88Q9D0N8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem88Q9D0N8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem88Q9D0N8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem88Q9D0N8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tmem88Q9D0N8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88Q9D0N8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88Q9D0N8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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