Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms