Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Khdc3Q9CWU5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Khdc3Q9CWU5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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