Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fcf1Q9CTH6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fcf1Q9CTH6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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