Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snw1Q9CSN1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms