Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ykt6Q9CQW1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ykt6Q9CQW1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms