Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccer1Q9CQL2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccer1Q9CQL2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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