Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Chchd1Q9CQA6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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