Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SrrtQ99MR6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms