Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp1b4Q99ME6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp1b4Q99ME6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms