Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Krt84Q99M73 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt84Q99M73 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms