Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Nus1Q99LJ8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms