Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rcbtb2Q99LJ7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms