Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp16Q99LG0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms