Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ciao1Q99KN2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ciao1Q99KN2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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