Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TrabdQ99JY4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms