Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apobec3Q99J72 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apobec3Q99J72 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms