Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Tspan1Q99J59 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan1Q99J59 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms