Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms