Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn16Q925N4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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