Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
PdgfdQ925I7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PdgfdQ925I7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms