Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim59Q922Y2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim59Q922Y2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.1 ms