Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubb6Q922F4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubb6Q922F4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms