Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Afg3l1Q920A7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Afg3l1Q920A7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms