Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mtmr4Q91XS1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms