Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp3Q91W36 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp3Q91W36 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms