Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Hps3Q91VB4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps3Q91VB4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms