Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sft2d2Q8VD57 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sft2d2Q8VD57 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms