Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fam20bQ8VCS3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Fam20bQ8VCS3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Fam20bQ8VCS3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fam20bQ8VCS3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fam20bQ8VCS3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Fam20bQ8VCS3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Fam20bQ8VCS3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Fam20bQ8VCS3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms