Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GcaQ8VC88 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GcaQ8VC88 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms