Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MyripQ8K3I4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MyripQ8K3I4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms