Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ssh3Q8K330 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ssh3Q8K330 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms