Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Mtmr3Q8K296 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtmr3Q8K296 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms