Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Znf628Q8CJ78 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf628Q8CJ78 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Znf628Q8CJ78 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf628Q8CJ78 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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