Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LgsnQ8CIX8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms